Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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