Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gja6Q6S5G4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms