Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nudcd1Q6PIP5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms