Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrn2Q6PHP6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrn2Q6PHP6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrn2Q6PHP6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrn2Q6PHP6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrn2Q6PHP6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrn2Q6PHP6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrn2Q6PHP6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrn2Q6PHP6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrn2Q6PHP6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrn2Q6PHP6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrn2Q6PHP6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Lrrn2Q6PHP6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrn2Q6PHP6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrn2Q6PHP6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrn2Q6PHP6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrn2Q6PHP6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrn2Q6PHP6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Lrrn2Q6PHP6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Lrrn2Q6PHP6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Lrrn2Q6PHP6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Lrrn2Q6PHP6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Lrrn2Q6PHP6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Lrrn2Q6PHP6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Lrrn2Q6PHP6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Lrrn2Q6PHP6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Lrrn2Q6PHP6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Lrrn2Q6PHP6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Lrrn2Q6PHP6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Lrrn2Q6PHP6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Lrrn2Q6PHP6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Lrrn2Q6PHP6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Lrrn2Q6PHP6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Lrrn2Q6PHP6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrn2Q6PHP6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms