Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc57Q6PHN1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms