Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfrlQ6PE55 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfrlQ6PE55 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfrlQ6PE55 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfrlQ6PE55 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfrlQ6PE55 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfrlQ6PE55 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfrlQ6PE55 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfrlQ6PE55 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfrlQ6PE55 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfrlQ6PE55 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfrlQ6PE55 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfrlQ6PE55 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfrlQ6PE55 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfrlQ6PE55 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfrlQ6PE55 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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PdgfrlQ6PE55 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfrlQ6PE55 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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PdgfrlQ6PE55 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfrlQ6PE55 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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PdgfrlQ6PE55 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfrlQ6PE55 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfrlQ6PE55 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfrlQ6PE55 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfrlQ6PE55 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfrlQ6PE55 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfrlQ6PE55 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfrlQ6PE55 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfrlQ6PE55 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfrlQ6PE55 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfrlQ6PE55 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfrlQ6PE55 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfrlQ6PE55 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfrlQ6PE55 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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PdgfrlQ6PE55 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfrlQ6PE55 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfrlQ6PE55 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfrlQ6PE55 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfrlQ6PE55 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfrlQ6PE55 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfrlQ6PE55 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfrlQ6PE55 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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PdgfrlQ6PE55 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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PdgfrlQ6PE55 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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PdgfrlQ6PE55 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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PdgfrlQ6PE55 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfrlQ6PE55 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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PdgfrlQ6PE55 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfrlQ6PE55 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfrlQ6PE55 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfrlQ6PE55 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfrlQ6PE55 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfrlQ6PE55 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfrlQ6PE55 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfrlQ6PE55 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfrlQ6PE55 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfrlQ6PE55 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfrlQ6PE55 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfrlQ6PE55 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfrlQ6PE55 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfrlQ6PE55 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfrlQ6PE55 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfrlQ6PE55 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfrlQ6PE55 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfrlQ6PE55 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfrlQ6PE55 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms