Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms