Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ParpbpQ6IRT3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms