Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scaf8Q6DID3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scaf8Q6DID3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms