Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Q6DFW0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q6DFW0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q6DFW0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q6DFW0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q6DFW0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q6DFW0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q6DFW0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q6DFW0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Q6DFW0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q6DFW0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms