Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms