Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntn4Q69Z26 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms