Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ino80dQ66JY2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ino80dQ66JY2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ino80dQ66JY2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ino80dQ66JY2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ino80dQ66JY2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ino80dQ66JY2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ino80dQ66JY2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ino80dQ66JY2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ino80dQ66JY2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ino80dQ66JY2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ino80dQ66JY2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ino80dQ66JY2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ino80dQ66JY2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ino80dQ66JY2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ino80dQ66JY2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ino80dQ66JY2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ino80dQ66JY2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ino80dQ66JY2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ino80dQ66JY2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ino80dQ66JY2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ino80dQ66JY2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ino80dQ66JY2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ino80dQ66JY2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ino80dQ66JY2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ino80dQ66JY2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ino80dQ66JY2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ino80dQ66JY2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ino80dQ66JY2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ino80dQ66JY2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ino80dQ66JY2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ino80dQ66JY2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms