Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf4Q64287 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms