Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Defa17Q64016 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Defa17Q64016 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Defa17Q64016 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa17Q64016 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Defa17Q64016 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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