Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CcncQ62447 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CcncQ62447 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CcncQ62447 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CcncQ62447 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CcncQ62447 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CcncQ62447 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CcncQ62447 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms