Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sema3bQ62177 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3bQ62177 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms