Protein–RNA interactions for Protein: Q61473

Sox17, Transcription factor SOX-17, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox17Q61473 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox17Q61473 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox17Q61473 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms