Protein–RNA interactions for Protein: Q61249

Igbp1, Immunoglobulin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igbp1Q61249 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Igbp1Q61249 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Igbp1Q61249 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Igbp1Q61249 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Igbp1Q61249 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Igbp1Q61249 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Igbp1Q61249 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Igbp1Q61249 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Igbp1Q61249 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Igbp1Q61249 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Igbp1Q61249 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Igbp1Q61249 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Igbp1Q61249 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Igbp1Q61249 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Igbp1Q61249 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Igbp1Q61249 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Igbp1Q61249 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Igbp1Q61249 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Igbp1Q61249 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Igbp1Q61249 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Igbp1Q61249 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Igbp1Q61249 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Igbp1Q61249 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Igbp1Q61249 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Igbp1Q61249 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Igbp1Q61249 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Igbp1Q61249 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Igbp1Q61249 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Igbp1Q61249 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Igbp1Q61249 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Igbp1Q61249 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms