Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stxbp3Q60770 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Stxbp3Q60770 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stxbp3Q60770 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stxbp3Q60770 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stxbp3Q60770 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stxbp3Q60770 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stxbp3Q60770 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stxbp3Q60770 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stxbp3Q60770 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stxbp3Q60770 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stxbp3Q60770 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stxbp3Q60770 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stxbp3Q60770 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stxbp3Q60770 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stxbp3Q60770 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stxbp3Q60770 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stxbp3Q60770 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms