Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Med13Q5SWW4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Med13Q5SWW4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Med13Q5SWW4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms