Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms