Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd40Q5SUE8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms