Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ5

Tns3, Tensin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns3Q5SSZ5 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tns3Q5SSZ5 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tns3Q5SSZ5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tns3Q5SSZ5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tns3Q5SSZ5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tns3Q5SSZ5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tns3Q5SSZ5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tns3Q5SSZ5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tns3Q5SSZ5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tns3Q5SSZ5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tns3Q5SSZ5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tns3Q5SSZ5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tns3Q5SSZ5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tns3Q5SSZ5 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tns3Q5SSZ5 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tns3Q5SSZ5 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tns3Q5SSZ5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tns3Q5SSZ5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tns3Q5SSZ5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tns3Q5SSZ5 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms