Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trdv4Q5R1A3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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