Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC83

Spata48, Spermatogenesis-associated protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata48Q5NC83 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spata48Q5NC83 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms