Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Vps41Q5KU39 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps41Q5KU39 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps41Q5KU39 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps41Q5KU39 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps41Q5KU39 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps41Q5KU39 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps41Q5KU39 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps41Q5KU39 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps41Q5KU39 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps41Q5KU39 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps41Q5KU39 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps41Q5KU39 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps41Q5KU39 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps41Q5KU39 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps41Q5KU39 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps41Q5KU39 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps41Q5KU39 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps41Q5KU39 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps41Q5KU39 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps41Q5KU39 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps41Q5KU39 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps41Q5KU39 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps41Q5KU39 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps41Q5KU39 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps41Q5KU39 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps41Q5KU39 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps41Q5KU39 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps41Q5KU39 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps41Q5KU39 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps41Q5KU39 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps41Q5KU39 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps41Q5KU39 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps41Q5KU39 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps41Q5KU39 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps41Q5KU39 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps41Q5KU39 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps41Q5KU39 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps41Q5KU39 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps41Q5KU39 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms