Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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Nlrc3Q5DU56 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrc3Q5DU56 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms