Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms