Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trappc3lQ4KL14 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc3lQ4KL14 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms