Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxn3Q499D0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms