Protein–RNA interactions for Protein: Q45KJ6

Lin28b, Protein lin-28 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28bQ45KJ6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin28bQ45KJ6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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