Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
4933416C03RikQ3V063 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms