Protein–RNA interactions for Protein: Q3V009

Tmed1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed1Q3V009 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms