Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms