Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
D130052B06RikQ3UW13 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
D130052B06RikQ3UW13 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
D130052B06RikQ3UW13 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
D130052B06RikQ3UW13 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
D130052B06RikQ3UW13 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
D130052B06RikQ3UW13 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
D130052B06RikQ3UW13 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
D130052B06RikQ3UW13 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
D130052B06RikQ3UW13 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
D130052B06RikQ3UW13 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
D130052B06RikQ3UW13 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
D130052B06RikQ3UW13 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
D130052B06RikQ3UW13 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
D130052B06RikQ3UW13 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
D130052B06RikQ3UW13 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
D130052B06RikQ3UW13 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
D130052B06RikQ3UW13 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
D130052B06RikQ3UW13 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
D130052B06RikQ3UW13 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
D130052B06RikQ3UW13 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
D130052B06RikQ3UW13 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
D130052B06RikQ3UW13 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
D130052B06RikQ3UW13 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
D130052B06RikQ3UW13 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
D130052B06RikQ3UW13 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
D130052B06RikQ3UW13 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
D130052B06RikQ3UW13 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
D130052B06RikQ3UW13 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
D130052B06RikQ3UW13 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
D130052B06RikQ3UW13 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
D130052B06RikQ3UW13 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
D130052B06RikQ3UW13 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
D130052B06RikQ3UW13 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
D130052B06RikQ3UW13 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
D130052B06RikQ3UW13 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
D130052B06RikQ3UW13 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
D130052B06RikQ3UW13 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
D130052B06RikQ3UW13 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
D130052B06RikQ3UW13 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
D130052B06RikQ3UW13 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
D130052B06RikQ3UW13 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
D130052B06RikQ3UW13 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
D130052B06RikQ3UW13 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
D130052B06RikQ3UW13 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
D130052B06RikQ3UW13 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
D130052B06RikQ3UW13 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
D130052B06RikQ3UW13 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
D130052B06RikQ3UW13 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
D130052B06RikQ3UW13 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
D130052B06RikQ3UW13 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
D130052B06RikQ3UW13 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
D130052B06RikQ3UW13 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
D130052B06RikQ3UW13 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
D130052B06RikQ3UW13 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
D130052B06RikQ3UW13 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
D130052B06RikQ3UW13 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
D130052B06RikQ3UW13 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
D130052B06RikQ3UW13 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
D130052B06RikQ3UW13 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
D130052B06RikQ3UW13 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
D130052B06RikQ3UW13 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
D130052B06RikQ3UW13 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
D130052B06RikQ3UW13 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
D130052B06RikQ3UW13 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
D130052B06RikQ3UW13 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
D130052B06RikQ3UW13 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
D130052B06RikQ3UW13 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
D130052B06RikQ3UW13 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
D130052B06RikQ3UW13 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
D130052B06RikQ3UW13 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
D130052B06RikQ3UW13 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
D130052B06RikQ3UW13 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
D130052B06RikQ3UW13 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
D130052B06RikQ3UW13 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
D130052B06RikQ3UW13 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
D130052B06RikQ3UW13 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
D130052B06RikQ3UW13 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
D130052B06RikQ3UW13 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D130052B06RikQ3UW13 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D130052B06RikQ3UW13 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D130052B06RikQ3UW13 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D130052B06RikQ3UW13 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D130052B06RikQ3UW13 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D130052B06RikQ3UW13 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D130052B06RikQ3UW13 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D130052B06RikQ3UW13 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D130052B06RikQ3UW13 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D130052B06RikQ3UW13 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D130052B06RikQ3UW13 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D130052B06RikQ3UW13 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D130052B06RikQ3UW13 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D130052B06RikQ3UW13 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D130052B06RikQ3UW13 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
D130052B06RikQ3UW13 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D130052B06RikQ3UW13 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D130052B06RikQ3UW13 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
D130052B06RikQ3UW13 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D130052B06RikQ3UW13 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
D130052B06RikQ3UW13 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms