Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnga4Q3UW12 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cnga4Q3UW12 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnga4Q3UW12 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnga4Q3UW12 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnga4Q3UW12 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnga4Q3UW12 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnga4Q3UW12 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnga4Q3UW12 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnga4Q3UW12 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnga4Q3UW12 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnga4Q3UW12 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnga4Q3UW12 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnga4Q3UW12 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnga4Q3UW12 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnga4Q3UW12 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnga4Q3UW12 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnga4Q3UW12 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnga4Q3UW12 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnga4Q3UW12 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnga4Q3UW12 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnga4Q3UW12 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnga4Q3UW12 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnga4Q3UW12 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnga4Q3UW12 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnga4Q3UW12 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnga4Q3UW12 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnga4Q3UW12 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnga4Q3UW12 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnga4Q3UW12 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnga4Q3UW12 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnga4Q3UW12 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnga4Q3UW12 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnga4Q3UW12 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnga4Q3UW12 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnga4Q3UW12 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnga4Q3UW12 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnga4Q3UW12 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnga4Q3UW12 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnga4Q3UW12 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnga4Q3UW12 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnga4Q3UW12 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnga4Q3UW12 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnga4Q3UW12 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnga4Q3UW12 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms