Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syndig1lQ3USQ7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms