Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ccdc190Q3URK1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ccdc190Q3URK1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ccdc190Q3URK1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc190Q3URK1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc190Q3URK1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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