Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms