Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM18

Lsg1, Large subunit GTPase 1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsg1Q3UM18 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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