Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK78

Pcgf5, Polycomb group RING finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf5Q3UK78 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcgf5Q3UK78 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms