Protein–RNA interactions for Protein: Q3UAW9

Brf2, Transcription factor IIIB 50 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf2Q3UAW9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms