Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U6N9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q3U6N9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3U6N9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3U6N9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3U6N9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3U6N9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms