Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hectd3Q3U487 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hectd3Q3U487 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hectd3Q3U487 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hectd3Q3U487 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hectd3Q3U487 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hectd3Q3U487 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hectd3Q3U487 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hectd3Q3U487 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hectd3Q3U487 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hectd3Q3U487 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hectd3Q3U487 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hectd3Q3U487 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms