Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 CT030194.1-201ENSMUST00000225507 532 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Fam117bQ3U3E2 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 4930442G15Rik-201ENSMUST00000213112 1000 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Fam117bQ3U3E2 AC118750.1-201ENSMUST00000214163 675 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Gm45525-201ENSMUST00000210800 389 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam117bQ3U3E2 Gm45587-201ENSMUST00000211548 765 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms