Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1F9

Pag1, Phosphoprotein associated with glycosphingolipid-enriched microdomains 1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pag1Q3U1F9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms