Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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