Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Smarca4Q3TKT4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms