Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR3

Nlrp4c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4cQ3TKR3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp4cQ3TKR3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms